Rawat Inap Puskesmas Punung, dengan konsep Rawat Inap di tengah taman dan Green area, sehingga menjamin suplai oksigen yang baik yang Insya Allah akan sangat membantu dalam proses kesembuhan. Rawat Inap Puskesmas Punung dibagi menjadi 4 kelas. yaitu Kelas III, Kelas II, Kelas I, dan VIP. mulai Tahun 2011 unti rawat inap Puskesmas Punung sudah dilengkapi dengan satu unit Rontgen dan USG, melengkapi alat alat diagnostik yang sudah ada sebelumnya. capaian hunian atau BOR tahun 2010 sekitar 75 %.
